Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb4A2A863 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb4A2A863 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms