Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall2Q9QX96 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms