Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata1Q9D5R4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata1Q9D5R4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms