Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms