Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY00

Ttc30b, Tetratricopeptide repeat protein 30B, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30bQ9CY00 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc30bQ9CY00 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms