Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RpainQ9CWY9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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