Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CRC3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CRC3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9CRC3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9CRC3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9CRC3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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