Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ergic3Q9CQE7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms