Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms