Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsmce2Q91VT1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce2Q91VT1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms