Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfr1Q8BP27 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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