Protein–RNA interactions for Protein: Q80TS7

Ddn, Dendrin, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdnQ80TS7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DdnQ80TS7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DdnQ80TS7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DdnQ80TS7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DdnQ80TS7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DdnQ80TS7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DdnQ80TS7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DdnQ80TS7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DdnQ80TS7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DdnQ80TS7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DdnQ80TS7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms