Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms