Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms