Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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