Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim15Q3UTD9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim15Q3UTD9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms