Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc4Q3UP24 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms