Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms