Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnnP61807 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms