Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a1P19437 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms