Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18525 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18525 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P18525 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P18525 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
P18525 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18525 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms