Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10477F6SW83 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms