Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms