Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms