Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF8Q9UPP1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms