Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb3Q9R1P1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms