Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms