Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms