Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms