Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms