Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms2Q9D4B1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sgms2Q9D4B1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Sgms2Q9D4B1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sgms2Q9D4B1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sgms2Q9D4B1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms2Q9D4B1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sgms2Q9D4B1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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