Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Mrpl55Q9CZ83 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl55Q9CZ83 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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