Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldnd1Q9CQX5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd1Q9CQX5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms