Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q99KU6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q99KU6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q99KU6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q99KU6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms