Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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