Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms