Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrip1Q8CBD1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip1Q8CBD1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip1Q8CBD1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip1Q8CBD1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip1Q8CBD1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip1Q8CBD1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip1Q8CBD1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip1Q8CBD1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip1Q8CBD1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip1Q8CBD1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrip1Q8CBD1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms