Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc172Q810N9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms