Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RimklaQ6PFX8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RimklaQ6PFX8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms