Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms