Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms