Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cd53Q61451 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cd53Q61451 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cd53Q61451 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cd53Q61451 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cd53Q61451 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cd53Q61451 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cd53Q61451 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cd53Q61451 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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