Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USPL1Q5W0Q7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms