Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms