Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN1

Defb47, Beta-defensin 41, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb47Q30KN1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb47Q30KN1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Defb47Q30KN1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Defb47Q30KN1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Defb47Q30KN1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Defb47Q30KN1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb47Q30KN1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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