Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF4Q2M2E3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF4Q2M2E3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms