Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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