Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cntn3Q07409 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms