Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emx2Q04744 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Emx2Q04744 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Emx2Q04744 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Emx2Q04744 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms