Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms